RefSeq数据库：基因组注释信息汇集地(refseq数据库注释信息)

RefSeq数据库是一个由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine, NLM）创建和维护的基因组注释信息汇集地。它是一个公共数据库，收集了来自不同生物物种的基因、转录本、蛋白质以及其他相关注释信息。RefSeq数据库的全称是“Reference Sequence Database”，意为‘参考序列数据库’，其中，参考序列指的是每个物种的基因组序列中的最长、更具代表性的序列，并且已被注释，可供各种研究使用和引用。

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RefSeq数据库的构成和应用

RefSeq数据库收集了来自700多个物种的参考序列，其中包括了多种真核生物和无核生物。该数据库中的每个物种都是以非常详细和标准化的方式进行注释。这些注释信息包括官方基因名称、描述性信息、外显子和内含子的位置、编码蛋白质的氨基酸序列、相邻基因、转录起始位点和终止位点、剪切位点等。此外，RefSeq数据库还包括了基因对应的cDNA序列以及染色体坐标，这些信息可用于研究者的物种识别和序列比对分析。

RefSeq数据库的应用广泛，尤其是在基因组学、转录组学和蛋白质组学等领域。研究者可利用RefSeq数据库进行基因识别和注释、编制基因组图谱和分析基因表达等。此外，RefSeq数据库还可以用于分析基因组变异、寻找疾病相关基因、预测基因功能等。在生物制药开发中，RefSeq数据库具有重要的应用价值，因为在制药过程中需要对生物体所产生的重要蛋白质进行表达和纯化，RefSeq数据库中的序列信息能够帮助制药研究人员确定最有效的表达载体和条件，提高表达蛋白质的效率和产量。

RefSeq数据库的发展历程

RefSeq数据库最初的构建始于1990年代初期，当时，这个数据库是由GenBank数据库的NCBI（美国国家生物技术信息中心）团队创建的。GenBank数据库是一个由国际同行评审组织策划创建和维护的生命科学数据托管库，它的主要作用是托管各种类型的分子遗传学数据库。当时，GenBank数据库已经收集了一个庞大的DNA序列库，但这些序列只包括最基本的注释信息。为了提供更加详细的注释信息，RefSeq数据库开始收集和整理注释数据，并将其与已知的DNA序列相结合，形成参考序列库。RefSeq数据库最初收集的物种数很少。但随着技术的进步和新物种的发现，数据不断增加并得到完善。

今天，RefSeq数据库已经成为一个庞大、完善和标准化的基因组注释数据库，其数据质量得到了国际同行评审机构的高度认可。此外，随着科学技术的不断发展和更新，RefSeq数据库也不断更新和完善自身的功能和数据质量，以满足越来越多研究者的需要。

RefSeq数据库的未来发展

在未来，RefSeq数据库还将面临许多挑战和机遇。其中一项挑战是随着科学技术的不断进步，许多新的技术和方法将出现用于DNA测序和基因组注释，这将要求RefSeq数据库持续引进和应用更先进的技术和方法。此外，随着分子遗传学研究的深入，相关数据库的数据量也将不断增加，这将对RefSeq数据库自身的构建和维护提出更高的要求。

尽管会面临一些挑战，但RefSeq数据库的未来发展仍将充满机遇。技术的进步将使得数据库的功能越来越强大，并且将为各种研究提供更加准确、细致和高效的基因组注释信息。此外，在生命科学领域的不断探索和发现将持续推动RefSeq数据库的发展。RefSeq数据库将会在未来继续发挥重要的作用，并为全球学术科研和生物产业的发展做出贡献。

相关问题拓展阅读：

mysql怎么查看表结构和注释
怎样获得数据库中字段的注释信息

mysql怎么查看表结构和注释

MySQL 查枣中看表结构简单命令。

一、简单描述表结构，字段类型desc tabl_name;

显示表结构，字段类型，物孙

主键

，是否为空等属性，但不显示

外键

。罩岩链

二、查询表中列的注释信息

select * from information_schema.columns where table_schema = ‘db’ #表所在数据库

and table_name = ‘tablename’ ; #你要查的表

三、只查询列名和注释

select column_name,

column_comment from information_schema.columns where table_schema =’db’ and

table_name = ‘tablename’ ;

四、#查看表的注释

select table_name,table_comment from information_schema.tables where table_schema = ‘db’ and table_name =’tablename’

ps：二～四是在元数据表中查看，我在实际操作中，常常不灵光，不知为什么，有了解的大侠请留印。

五、查看表生成的DDL show create table table_name;

1、打开mysql命令行编辑器。2

输入密码，登录Mysql数据库。3、先显示数据库，选择一个要创建表的数据库。4、使用那个数据库，当然也可以直接新建一个数据库。胡孙5、在那个数据库中创建一个表。6、最后斗棚，输空做则入describe 表名；就可以显示表结构了。

MySQL是一种开放源代码的关系型数据库管理系统（RDBMS），使用最常用的数据库管理语言–结构化查询语言（SQL）进行数据库管理。

MySQL是开放源代码的，因此任何人都可以在General Public License的许可下下载并根据个性化的需要对其运或进行修改。

MySQL因为其速度、可靠性和适应性而备受关注。大多数人都认为在不需要事务化处理的情况下，MySQL是管理内容更好的选择。

中文名

MySQL数据库

类型

开放源代码的关系型

说明

数据库管理系统

标志

sakila

怎样获得数据库中字段的注释信息

Create view FieldDesc

select o.name as oname, c.name as cname,convert(varchar(30),p.value) as value,p.allid as pallid,t.name as tname

from syscolumns c

join systypes t on c.xtype = t.xtype

join sysobjects o on o.id=c.id

left joinsysproperties p on p.allid=c.colid and p.id=o.id

where o.xtype=’U’

上面是创建注释查询试图。通过上面的语句可以看到某敬樱表某字段的注释迹稿余

创建注释（N’user’, N’dbo’, N’table’ 为固定的）

–为表添加描述信息

EXECUTE sp_addextendedproperty N’MS_Description’, ‘人员信息表’, N’user’姿滚, N’dbo’, N’table’, N’表’, NULL, NULL

–为字段a1添加描述信息

EXECUTE sp_addextendedproperty N’MS_Description’, ‘姓名’, N’user’, N’dbo’, N’table’, N’表’, N’column’, N’a1′

–为字段a2添加描述信息

EXECUTE sp_addextendedproperty N’MS_Description’, ‘性别’, N’user’, N’dbo’, N’table’, N’表’, N’column’, N’a2′–更新表中列a1的描述属性：

EXEC sp_updateextendedproperty ‘MS_Description’,’字段1′,’user’,dbo,’table’,’表’,’column’,a1

–删除表中列a1的描述属性：

EXEC sp_dropextendedproperty ‘MS_Description’,’user’,dbo,’table’,’表’,’column’,a1

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