轻松愉快地安装FFTW在Linux系统上(fftwlinux安装)

FFTW是一款用于实现快速傅立叶变换的开源软件包，它被广泛应用于信号和图像处理，数值分析以及物理学等领域。在Linux系统上安装FFTW可能会让许多人感到困惑，但事实上只需要几个简单步骤即可完成安装。本文将重点介绍在Linux系统上安装FFTW的方法，帮助大家轻松愉快地享受快速傅立叶变换带来的便捷。

我们注重客户提出的每个要求，我们充分考虑每一个细节，我们积极的做好网站设计、成都做网站服务，我们努力开拓更好的视野，通过不懈的努力，成都创新互联公司赢得了业内的良好声誉，这一切，也不断的激励着我们更好的服务客户。 主要业务：网站建设,网站制作,网站设计,小程序开发,网站开发,技术开发实力，DIV+CSS，PHP及ASP，ASP.Net，SQL数据库的技术开发工程师。

之一步：准备工作

在开始安装前，我们需要确认已安装以下工具：

– 编译器：一般情况下，Linux系统都会默认安装gcc编译器，如果没有安装可以使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get update

sudo apt-get install build-essential

“`

– cmake：cmake是常用的编译工具，负责生成Makefile。使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get install cmake

“`

– Git：如果需要从GitHub上下载FFTW，请使用以下命令进行安装。

“`bash

sudo apt-get install git

“`

第二步：下载FFTW

我们可以通过两种方式获取FFTW，一种是从官方网站下载源码包，另一种是从GitHub上下载源码。

1.从官网下载源码包

打开FFTW官网（http://www.fftw.org/），选择适合自己的版本进行下载。我们以FFTW 3.3.9为例，下载完成后进入下载目录，解压文件。

“`bash

tar -xzvf fftw-3.3.9.tar.gz

“`

2.从GitHub上下载源码

使用Git从GitHub上下载源码包，使用以下命令进行下载。

“`bash

git clone https://github.com/FFTW/fftw3.git

“`

第三步：编译FFTW

进入解压缩目录中新建一个build目录，并在其中进行编译操作。

“`bash

mkdir build

cd build

cmake ..

make

sudo make install

“`

执行make install指令需要管理员权限，如果当前用户权限不够，可以使用sudo以管理员身份执行命令。

这里需要注意的是，在运行cmake之前，可以使用以下命令来查看系统是否支持各种选项。

“`bash

cmake -LH

“`

这个命令列出了所有支持的选项以及它们的默认值。如果需要更改默认值，可以在cmake指令中添加参数来更改。

例如，如果需要将FFTW安装到非默认位置，可以执行以下命令。

“`bash

cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/fftw3 ..

“`

第四步：测试FFTW

测试安装是否成功，可以使用以下命令来验证。

“`bash

make check

“`

该命令运行了一些测试并输出了结果。如果出现任何错误，需要检查安装是否有误，并重复执行前面的步骤。

第五步：使用FFTW

现在，FFTW已经被成功地安装在Linux系统上。它包含许多库和实用程序，可以通过命令行调用进行使用。

在程序中使用FFTW是很容易的，只需要在代码中包含头文件，链接相应的库文件即可。

“`c

#include

int mn()

{

fftw_complex *in, *out;

fftw_plan p;

int N = 512;

in = (fftw_complex*) fftw_malloc(sizeof(fftw_complex) * N);

out = (fftw_complex*) fftw_malloc(sizeof(fftw_complex) * N);

p = fftw_plan_dft_1d(N, in, out, FFTW_FORWARD, FFTW_ESTIMATE);

fftw_execute(p); /* repeat as needed */

fftw_destroy_plan(p);

fftw_free(in); fftw_free(out);

return 0;

}

“`

在上述示例代码中，我们使用了三个FFTW库函数：fftw_malloc，fftw_plan_dft_1d和fftw_execute，它们分别用于内存分配、计算和指定的傅里叶变换。

结论：

相关问题拓展阅读：

• 为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好

为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好

一个可能的原因是 boost 的版本较低。

改进办法是执行如下命令：

# sudo apt-get install libboost-all-dev 

然后按照文章步骤安装就可以了，为了便于阅览，我们把步骤也贴在这里：

机器操作系统为 Ubuntu14.04，安装了 CUDA7.5。

在家目录下建立 gromacs 目录做为工作目录下，搭困拷贝了 4 个

安装包

：

openmpi-1.6.5.

tar.gz

fftw-3.3.3.tar.gz

cmake-2.8.9.tar

gromacs-5.0.4.tar.gz

1.安装 openmpi

$ cd ~/gromacs

$ tar –xvf openmpi-1.6.5.tar.gz

$ cd openmpi-1.6.5

$ ./configure –prefix=/opt/openmpi

$ sudo make

$ sudo make install

2.安装 fftw 

$ 察枝哗cd ~/gromacs

$ tar –xvf fftw-3.3.3.tar.gz

$ cd fftw-3.3.3

$ ./configure –prefix=/opt/fftw –enable-float –enable-shared

$ sudo make

$ sudo make install

3.安装 cmake

$ cd ~/gromacs

$ tar xvf cmake-2.8.9.tar

$ cd cmake-2.8.9

$ ./bootstrap

$ sudo make

$ sudo make install

4.编译 gromacs GPU 版本

$ cd ~/gromacs

$ mkdir build-gpu

$ cd build-gpu

$ sudo cmake .. -DFFTWF_LIBRARY=/opt/fftw/lib/libfftw3f.so -DFFTWF_INCLUDE_DIR=/opt/fftw/include  -DGMX_MPI=ON –DGMX_GPU=ON -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/gromacs-5.0.4-gpu

$ sudo make

$ sudo make install

步骤 4 编译 gromacs 时，cmake 步骤如果有如下提示信息的话，败行说明 boost 版本低：

配置环境变量：

$ vi ~/.bashrc

增加如下内容：

export PATH=$PATH:/usr/local/cuda/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda/lib64

export PATH=$PATH:/opt/openmpi/bin

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi/lib

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/fftw/lib

export PATH=$PATH:/opt/gromacs-5.0.4-gpu/bin 

保存退出。 

关掉当前终端窗口，重新开启一个终端窗口。 

下面我们测试一下样例程序在单 GPU 和多 GPU 的数据。

测试服务器配置如下：

CPU：2 颗 E5-2620（6 核心）

内存：64G

GPU：2 片 K80（每片 K80 有 2 核心，所以有 4 个 GPU 设备） 

在家目录下建立目录 test，将 ADH_bench_systems.tar.gz 拷贝到该目录下。

$ cd ~/test

$ tar xvf ADH_bench_systems.tar.gz

$ cd adh_cubic

$ grompp_mpi –f rf_verlet.mdp 

单 GPU 的调用命令是： 

$ mdrun_mpi

或

$ mpirun –np 1 mdrun_mpi

多 GPU 的调用命令是：

$ mpirun –np 2 mdrun_mpi

或

$ mpirun –np 3 mdrun_mpi

或

$ mpirun –np 4 mdrun_mpi

单 GPU 设备执行数据如下图：

2 个 GPU 设备执行数据如下图：

3 个 GPU 设备执行数据如下图：

4 个 GPU 设备执行数据如下图：

fftw linux 安装的介绍就聊到这里吧，感谢你花时间阅读本站内容，更多关于fftw linux 安装,轻松愉快地安装FFTW在Linux系统上,为什么编译出的 gromacs 多 GPU 加速效果不好的信息别忘了在本站进行查找喔。

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